La República de Chile y la República de Indonesia establecieron relaciones diplomáticas el 29 de septiembre de 1965. Sin embargo, los lazos entre ambas naciones se remontan a décadas anteriores, destacando la labor consular del escritor y diplomático chileno Pablo Neruda en Batavia (Yakarta) entre 1930 y 1932, durante el período colonial holandés.

Chile reconoció oficialmente la independencia de Indonesia en 1950. Posteriormente, abrió su embajada en Yakarta en noviembre de 1977, mientras que Indonesia estableció su representación en Santiago en 1991. Durante casi seis décadas de relaciones diplomáticas, ambos países han alcanzado acuerdos significativos, especialmente en las áreas económica y comercial.

En 2019, Chile e Indonesia firmaron un Acuerdo de Asociación Económica Integral, el cual ha servido como plataforma para profundizar sus lazos económicos. Además, han cooperado en diversos ámbitos, como telecomunicaciones, pesca y acuicultura, agricultura, certificación halal, y control de medicinas, entre otros. Asimismo, se destaca la colaboración parlamentaria entre ambas naciones.

A nivel regional, Indonesia ha desempeñado un papel clave en apoyar los esfuerzos de Chile para acercarse al Sudeste Asiático. Como Socio de Diálogo de la ASEAN, Chile firmó el Tratado de Cooperación y Amistad en 2016, con el respaldo de Indonesia.